
ההבדל בין אונייה לספינה לא תמיד ברור, אך ישנם כמה הבדליים עיקריים שיכולים לעזור להבחין בין השניים.
ההבדלים העיקריים
על פי גודל
בדרך כלל, אונייה היא כלי שיט גדול יותר מספינה. מונח "אונייה" מתייחס לרוב לכלי שיט גדול, כמו אוניות משא או אוניות נוסעים. ספינה, מצד שני, יכול להתייחס לכלי שיט קטן יותר או בינוני, אך גם יכול להיות כלי שיט גדול בהתאם להקשר.
על פי שימוש
לעיתים, ישנה הבחנה בין השניים לפי מטרת השימוש. "אונייה" משמשת לרוב ככינוי לאוניות נוסעים, אוניות משא או כלי שיט המיועדים לתובלה ימית רחוקה, בעוד ש"ספינה" יכולה להיות כלי שיט קטן יותר שנמצא בשימוש לצרכים שונים, כמו דיג, ספורט ימי או כלי שיט מסחריים קטנים.

הקשר השפתי
בעברית, המילים "ספינה" ו"אונייה" עשויות לשמש באופן חילופי, במיוחד בהקשרים יומיומיים, ואין הבחנה ברורה בין השניים. לעיתים, המילה "ספינה" תופסת מקום יותר עממי או שגור.
לשון המקרא (ימאות) אונייה; וגם: כלי שיט בינוני בעל סיפון, הגדול מסירה וקטן מאונייה, לשימוש בים הפתוח, באגמים ובנהרות.
הגדרה רשות הספנות
על פי ההגדרות הרשמיות של רשות הספנות והנמלים בישראל ספינה היא "כלי שיט אשר תפוסתו ברוטו עד 100 טון ואורכו המרבי 7–24 מ'". אונייה היא כלי שיט שאורכו מעל 24 מטרים, או בעל תפוסה שמעל 100 טון. ככלל, אונייה מוגדרת ככלי שיט גדול יותר, בעל טווח ארוך יותר ויכולת להפליג למשך זמן רב יותר.
לסיכום
ההבדל העיקרי בין ספינה לאונייה הוא בגודל ובשימוש, אם כי המילים עשויות להתערבב בהקשרים שונים.
◊ במבט אישי – אצלי ההבדל בין ספינה לאונייה היה ברור כי במסגרת שירותי הצבאי בסדיר בחיל הים הפלגתי על ספינת חיל הים אחי "בת-ים" ואילו בשירותי בצי הסוחר הישראלי ההפלגה הראשונה שלי כקצין מכונות ראשי הייתה על האונייה "צים וירג'יניה". למרות שבעברית החדישה ישנה המילה ספינה, העדפתי כאן באתר seamanphot להשתמש במילה השגורה בקרב אנשי הים אונייה.